Основные направления научной деятельности ИКИР в области физики солнечно-земных связей, утвержденные постановлением Бюро Отделения общей физики и астрономии РАН от 18.03.98 г. № 5, §35 и постановлением Президиума Дальневосточного отделения от 18.03.98 г. № 17:
- контроль и прогнозирование солнечной активности;
- исследование вариаций космических лучей;
- диагностика состояния и параметров ионосферно-магнитосферной плазмы;
- влияние солнечной активности на условия распространения радиоволн СДВ и КВ диапазонов;
- изучение и контроль состояния электромагнитного поля естественных источников в широком диапазоне частот в различных условиях ионосферно-магнитосферной возмущенности;
- обнаружение и выделение оперативных электромагнитных предвестников землетрясений и их проявлений в ионосферно-магнитосферной плазме;
- создание адаптивной математической модели нестационарной ионосферы средних и высоких широт;
- проведение обсерваторских наблюдений за состоянием параметров солнечной активности, магнитосферы, ионосферы и естественного электромагнитного поля.
Институт проводит работы по федеральной целевой программе России "Развитие федеральной системы сейсмологических наблюдений и прогноза землетрясений" (1995-2000 г. г.) в части организации комплексной системы радиофизического контроля электромагнитного поля с целью оперативного прогноза сильных землетрясений.
ИКИР ДВО РАН выполняет НИР по четырем грантам совместного фонда регионального конкурса РФФИ и администрации Камчатской области: "Фундаментальные исследования по проблемам природных катастроф Камчатки", проводит работы по хоздоговорам с Секцией прикладных проблем РАН, ОИЗМИРАН.